Los órganos de gobierno y de gestión de la sociedad son la Junta General, el Consejo de Administración y la Gerencia. La Junta General está integrada por dos socios al 50% que son el Ajuntament de Badalona y la Administración de la Generalitat de Cataluña, que se representan en esta por sus correspondientes representantes legales designados y está presidida por el alcalde de Badalona, Sr. Rubén Guijarro. El Consejo de Administración está integrado por catorce personas (siete en representación del Ajuntament de Badalona y siete en representación de la Administración de la Generalitat), es presidido por el Alcalde y se designan un Vicepresidente 1º en representación de la Administración de la Generalitat y un Vicepresidente 2º en representación del Ajuntament. El Consejo de Administración puede optar por nombrar, de entre sus miembros, uno o más consejeros delegados, responsabilidad que es para cinco años, renovable una o más veces por un período de igual duración. Actualmente la figura del Consejero Delegado no existe. La gestión recae en la Gerencia. El Sr. Imanol Sanz es gerente de Marina Badalona desde el 1 de febrero de 2013.