Los órganos de gobierno y dirección de la sociedad son la Junta General, el Consejo de Administración y la Dirección. La Junta General está compuesta por dos socios al 50% que son el Ajuntament de Badalona y la Administración de la Generalitat de Catalunya, que representan a la misma por sus respectivos representantes legales designados y está presidida por el alcalde de Badalona, D.Rubén Guijarro. El Consejo de Administración está compuesto por catorce personas (siete en representación del Ajuntament de Badalona y siete en representación de la Administración de la Generalitat), está presidido por el Alcalde y se nombra un Vicepresidente 1º en representación de la Administración de la Generalitat y un Vicepresidente 2º en representación del Ayuntamiento. El Consejo de Administración podrá optar por nombrar, entre sus miembros, a uno o varios consejeros delegados, una responsabilidad de cinco años, renovable una o más veces por un período de igual duración. Actualmente la figura del CEO no existe. La gestión recae en la dirección. Imanol Sanz es gerente de Marina Badalona desde el 1 de febrero de 2013.